MOTHER3i es la segunda banda sonora oficial de Mother 3, contiene 15 canciones directamente tomadas de Mother 3, a diferencia de MOTHER3+, ninguna de las canciones esta remasterisada o rehecha. Sin embargo su calidad general suena mucho mejor fuera de un Game Boy Advance. A pesar de la falta de trabajo extra en las pistas, esto es considerado como el favorito de los fans, ya que ofrece una amplia variedad de música de la partida. Compuesto por Shogo Sakai, y lanzado en la iTunes Music Store, el 6 de febrero de 2007 en Japón, y el 1 de abril de 2007 en América del Norte. 

Las canciones del álbum también aparecen en Super Smash Bros. Brawl, en su forma original o remezclado.

Canciones

  1. "Welcome to MOTHER3 World" – 3:48
  2. "Tatsumairi" – 2:44
  3. "Twist and Battle" – 4:33
  4. "Gentle Rain" – 4:59
  5. "Mambo and Battle" – 3:40
  6. "Theme of Duster" – 3:22
  7. "The Castle of Osohe" – 4:59
  8. "Funky Monkey Dance" – 4:39
  9. "Oh, Buta-Mask" – 3:14
  10. "Memory of Tatsumairi" – 4:21
  11. "With Magypsy" – 3:26
  12. "Do Not Disturb" – 4:47
  13. "Flowers" – 4:22
  14. "Theme of Bad Boy" – 7:10
  15. "From Utopia" – 5:51
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